在吉隆坡举行的2026-27赛季亚冠二级联赛抽签仪式中，上海申花与日本球队町田泽维亚被分在同一小组。本赛季的亚冠二级联赛共有32支球队参赛，分为8个小组，每组由四支队伍组成。在小组赛的抽签过程中，采用了联赛回避原则，确保来自同一联赛的球队不会在同一小组内。

作为2025赛季中超联赛的亚军，上海申花是本赛季唯一代表中超参与亚冠二级联赛的球队。在东亚区的分组中，上海申花被划分为第二档，而第一档则包括町田泽维亚、首尔FC和江原FC等实力强劲的对手。抽签嘉宾范志毅将上海申花抽入G组，组内还包括柴桢及淡滨尼流浪队。值得注意的是，申花避开了澳大利亚球队，这意味着他们将免于长途旅行所带来的额外疲惫。

2026-27赛季的亚冠二级联赛小组赛预计于9月15日至12月9日间进行，紧接着淘汰赛阶段将在2027年2月展开。回顾过去表现，2025-26赛季，参加亚冠二级联赛的北京国安仅取得1胜2平3负的成绩，以5分名列E组最后一位。此外，在2024-25赛季，浙江队也未能顺利晋级淘汰赛，仅收获3胜3负的成绩，最终排名F组第三。